A UMC possui dois campi em Mogi das Cruzes que juntos oferecem 47 cursos nas áreas de Exatas, Humanas e Saúde. O campus I, localizado em uma área de 86 mil m², é dividido em 16 prédios. São instalações que abrigam desde clínicas (Psicologia, Odontologia), núcleos de pesquisa e estúdios (Rádio e TV) até unidades prestadoras de serviços, como uma escola de idiomas e uma agência bancária, que atendem diretamente aos alunos e à comunidade.

Já o campus II da UMC, localizado em uma área de 155.186,50 m², abriga as instalações do Centro Esportivo.

A Universidade também conta com um campus em São Paulo (campus Villa-Lobos), construído recentemente em uma área de 21.317 m² no bairro da Vila Leopoldina, em São Paulo. O conjunto é dividido em um pavimento térreo e três blocos de edifícios.

Com o objetivo de aprimorar os cursos oferecidos na área de saúde, a UMC mantém um Instituto Central de Saúde localizada a poucos metros do campus I. Em uma área de 1.500,67 m² (3.458,68 m² de área construída), o prédio é dividido em dois blocos (A e B) cujos edifícios são interligados por passarelas. A unidade conta com recepção, lanchonete, 46 consultórios, vestiários, sala bera (para aulas de psicologia), sala de discussão de casos, entre outras instalações.

Os campi da UMC são inteiramente adequados às atividades de ensino desenvolvidas em cada área do conhecimento. Para tanto, possuem ambientes, laboratórios e equipamentos especialmente projetados para as mais diversas finalidades. Além disso, contam com infra-estrutura de apoio administrativo e às necessidades de lazer e bem-estar dos alunos.